小程序备案流程包括以下步骤：

1. 准备备案资料：公司及相关证照资料，包括工商营业执照、组织机构代码证、税务登记证、法人身份证等；小程序相关资料，包括小程序名称、小程序简介、小程序类目等。

2. 在微信公众平台后台进行备案申请：登录微信公众平台后台，在“基本设置”-“开发者工具”-“小程序管理”中选择“备案信息”，填写相关信息并提交。

3. 等待微信官方审核：微信官方会对备案信息进行审核，审核通过后会生成小程序备案号。

4. 进行域名备案：如果小程序需要使用域名，则需要进行域名备案。具体备案流程与准备资料可参考当地相关部门的要求。

需要注意的是，小程序备案和域名备案是两个不同的流程，需要分别进行。此外，小程序备案需要遵循相关法规，确保备案信息真实、准确、完整。